Este espaço pretende manter as coleções iniciais, com maior destaque na área da arqueologia, se bem que hoje encontra-se mais vocacionado para a arte moderna e contemporânea portuguesa, nomeadamente pintura e escultura, tendo como principais referências os pintores António Carneiro e Amadeo de Souza-Cardoso. Amadeo constitui a principal referência do Museu, de que é patrono e a aproximação à sua obra torna-a em instrumento de uma pedagogia da modernidade, com os percursos visíveis do Cubismo à Abstracção, com as notícias do Futurismo, as marcas do Expressionismo e as premonições do Dadaísmo e seus absurdos.